公元前47年，亚历山大围城战开始，该城遭受了严重破坏。

大约在这个时期，亚历山大图书馆被焚毁。

随着罗马增援的到来，发生了公元前47年的尼罗河战役(battleoftheNile)，最终恺撒和克利奥帕特拉七世获胜，迫使托勒密十三世逃离了城市。

据说他在公元前47年1月13日试图渡过尼罗河时溺水身亡。

关于他是否在逃跑还是试图进行谈判，历史资料中没有明确记载。

克利奥帕特拉七世最终成为埃及的无可争议的统治者，她任命了他们的弟弟托勒密十四世(ptoleyxIV)作为新的共治者(公元前47–44年在位)。

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托勒密十四世·菲洛帕托（ptoleyxIVphilopator）即位时大约12岁。

他与姐姐克利奥帕特拉结婚，但克利奥帕特拉继续与罗马独裁者恺撒(GaiJulicaesar)保持恋爱关系。

托勒密十四世被认为仅名义上在位，作为对埃及传统的妥协，而克利奥帕特拉实际掌握着权力。

公元前44年3月15日，恺撒在罗马被布鲁图斯(brut)和卡修斯(cassi)等一群阴谋者刺杀。

托勒密十四世很快也去世了。

有一块提到他仍然在世的铭文，日期为公元前44年7月26日。

虽然无法确定，但普遍推测克利奥帕特拉可能用“乌头毒药”毒死了她的共治者，以便让她的侄子托勒密十五世·凯撒(ptoleyxVcaesar)取而代之。

托勒密十五世是她与恺撒所生的儿子，他于公元前44年9月2日被宣布为共治者，母亲计划支持他作为父亲的继承人。

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托勒密十五世·凯撒(ptoleyxVcaesar)，公元前47年6月23日出生，公元前30年8月29日去世，绰号凯撒里昂(\"小凯撒\")，是托勒密埃及的最后一位法老。

他与母亲克利奥帕特拉七世一同统治埃及，直到公元前30年8月12日她去世，之后他成为唯一的统治者，然后被屋大维(octavian)下令处死。

屋大维就是罗马帝国的第一任皇帝，改名为奥古斯都(Augt)。

凯撒里昂是克利奥帕特拉与恺撒(GaiJulicaesar)的长子，也是恺撒唯一已知的亲生儿子，故以其父亲的名字命名。

他是托勒密王朝的最后一位统治者。