据推测，托勒密四世的叔叔利西马科斯（Lysiach）可能在此时被谋杀。

他的母亲贝勒尼基二世（bereniceII）被认为支持其弟弟马加斯（agas），后者掌握了重要的军事指挥权，并且深受军队的欢迎，因此马加斯在浴室中被活活烫死。

贝勒尼基二世随后不久也去世；据说她是被毒死的。

相比之下，托勒密四世的姐姐阿尔西诺伊三世（ArsoeIII）则被安排与国王密切联系。

到公元前220年时，他们已经成婚。

兄妹婚姻在埃及王室中相当常见，包括托勒密家族在内。

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公元前222年，安条克三世继承了塞琉古王位，他迅速展现出一位充满活力的领导者形象，决心恢复塞琉古的力量，并扭转第三次叙利亚战争（thirdSyrianwar）中塞琉古遭受的损失。

公元前221年，即他即位的次年，安条克三世入侵了托勒密统治下的科尔-叙利亚（ele-Syria）。

然而，他被该地区的托勒密总督提奥多图斯（theodot）击退，不得不转而东进，以应对他的米底（dia）总督莫隆（olon）发起的叛乱。

公元前219年春，安条克三世再次发起进攻，攻占了关键的港口城市塞琉西亚·皮埃里亚（Seleuciapieria）——这座城市被誉为“塞琉古王朝的摇篮”，自公元前246年起一直在托勒密控制之下。

此后不久，由于在托勒密宫廷中失去支持，提奥多图斯转而投向塞琉古一方，将科尔-叙利亚以及大部分托勒密舰队带给了安条克三世。

安条克三世接收了泰尔（tyre）和托勒迈斯·阿克（ptoleaisAke）的投降，但在围攻西顿（Sidon）和多拉（dora）的过程中陷入了漫长的僵局。

此时，亚历山大港（Alexandria）爆发了一场叛乱，由斯巴达的克利奥米尼三世（enesIII）领导。

普鲁比乌斯（polybi）将这场叛乱描绘为对托勒密四世·菲洛帕托（ptoleyIVphilopator）政权的严重威胁。

托勒密三世·尤尔盖特斯曾承诺让克利奥米尼三世重返斯巴达王位，克利奥米尼三世当时正率领3000名雇佣兵居住在亚历山大港，但托勒密三世的去世使这些计划流产。

最初，托勒密四世和索西比乌斯（Sosibi）对克利奥米尼三世优待有加，视其为制衡托勒密四世之弟马加斯（agas）的工具。

然而，马加斯去世后，托勒密四世对克利奥米尼三世的兴趣逐渐消退，索西比乌斯也将其软禁于家中。

公元前219年，当托勒密四世在卡诺普斯（op）时，克利奥米尼三世趁机逃脱，试图发动武装起义反对索西比乌斯。

他和追随者袭击了亚历山大港的主堡，试图解救被囚禁的士兵，但进攻失败，亚历山大港的市民也未响应他们的号召起义。

最终，克利奥米尼三世和他的追随者选择自尽。