流寇们还高举旗帜，写着「古元真龙皇帝」六个大字，既；蒙元之后的大宋天子，指续~小明王：韩林儿，政权统治。

农民军各部首领们，合乐共饮庆贺胜利，并开始劫掠凤阳行都督府三日。

明凤阳行都督府监军：卢九德、明登莱总兵：杨御蕃，以三千川军前来救凤阳行都督府，恰好与赶到的南直隶应天府南京城中军都督府卫所军相遇。

而流寇们得知大批明军即将到来，就用竹席往皇陵卫里面的神祠上盖去，不想让大明先祖们看见自己的罪行（毕竟都是穷人出身！）在用瓜皮锤、破甲锤，往神像上砸去，以破坏大明龙脉之气。

之后才拔营南下，沿途一路杀掠州府县卫所官兵无数，南逃入庐州府。

很快明五司总督兼兵部尚书：洪承畴，与明山东总镇巡抚：朱大典，等部明军汇合，一起拦截剿贼。

还在南直隶奔逃的流寇们，又攻陷了庐州府巢县、舒城县，以至于明舒城县知县：章可试，关闭三门，只开西门诱敌深入，让其陷于深坑当中斩死1千人。

因而让流寇们吃亏，转而去掠夺庐州府霍山县、庐州府首府合肥县。

未时，农民军们围攻六安州，破州城之后聚集干柴百梱在城内点火焚烧，听其哀号为笑乐！又把数千官员夫妇去掉衣裳，驱赶到城下集体侮辱，若有抵抗立即杀之，掠夺三日才逃走。

朝廷得知南直隶有变，就让户部出内帑二十万两黄金当做剿饷、又发太仆寺十万两黄金，输送到陕西承宣布政使司西安府。

其中湖广承宣布政使司出饷银十九万两，发放给重镇官兵，而各部盐课提举司出饷银十万两，送交南直隶淮安府、扬州府，等地以防流寇。

正月27日，明兵部尚书兼五司总督：洪承畴，调集南北两军七万人、马一万五千匹，再让户部发给每位士兵一日三分银（约等21文钱，21个铜板）、米一升五合、马日草一束、后勤火头军一日二分银（约等14文钱，14个铜板）、豆三升、二分银总计五个月，约为十一万白银。

随后明军们士气大增，火速追击流寇，迫使农民军急忙从庐州府舒城县抵达庐江县。

城内的军民们见状，连忙以金银恳求流寇不要屠城，在佯装答应流寇们进城。

待夜半时分，流寇们驻扎下来之后，军民们就直接袭击城内的流寇，逼得流寇们连夜逃走，前去南直隶无为州。

此刻明五司总督兼兵部尚书才刚抵达河南承宣布政使司，就吓得中原境内的流寇们，又跑去河南府潼关卫境内。

而明五司总督派遣了明河南府副总兵：来胤昌，以1千2百人前往陕西承宣布政使司西安府镇守，在令明重庆府总兵：秦翼明、明重庆府左参将：游来，朝官道向南直隶徐州方向出发，速去围剿江南流寇。

此刻农民军：满天星（张大寿）、西营八大王（张献忠）等部，攻打安庆府桐城县不利。

故此流寇们骑兵绕城下呼降，守城明将们则用弓箭、火铳，射中其满天星的腰，让他夜走安庆府潜山县、太湖县，之间。

不过山中多有山贼、猎手，专射虎豹，且药弩窝弓都设有，听闻流寇肆意妄为，便联合在这一带结寨杀贼，让流寇们吃了亏，不敢与山贼们硬碰硬。

毕竟后方，还有大批明军追兵，所以流寇们便向西，进入湖广承宣布政使司黄州府麻城县内避难。

2月10日，部分还在南直隶的流寇们，攻陷了安庆府潜山县，在转入湖广承宣布政使司黄州府罗田县。

同时明山西总镇总兵：曹文诏，正在河南承宣布政使司围剿开封府陈州、许州，等地流寇，而湖广承宣布政使司的流寇们依旧还未逃出南直隶，还在攻打安庆府太湖县。

以至于中原流寇们迫于诸路明军的收缩合力围剿，不得不从南阳府南下。

又在明唐亲王：朱聿键，出钱粮的情况下，使得明军士气高涨，逼迫流寇从湖广承宣布政使司德安府应城县，转移阵地进驻到襄阳府枣阳县内。

在汝宁府的流寇们，则南下也进入了湖广承宣布政使司黄州府。